A high-throughput experimental evolution platform for the flexible optimization of antimicrobial probiotic and biocontrol strains
2023
2027
BOF PRISM
Digital pathology as a proxy for molecular profiling of prostate tumors
2022
2026
Belspo Pame
Improved dectection of pathogenic strains from metagenomics data" (PAME)
2022
2025
ICON Mission: Adapt
Adapt: Affiniteit en Ontwikkelbaarheid via AI voor Proteïnebehandelingen
2024
2026
FWO PhD Marija Pizurica
Deep learning models for predicting molecular tumor properties directly from Whole Slide images
2022
2026
FWO PhD Lorde Depuydt
Search schemes for sequence alignment to pan-genome graphs
2021
2025
FWO PhD Luca Renders
Search schemes for sequence alignment
2021
2025
Past projects
BOF PRIME
Forwarding precision oncology by integrating cohort-derived molecular and clinical information
2019
2024
FWO RECAN
Hoge resolutie netwerken om het effect van netwerkherstructuring in kanker te bestuderen
2020
2023
FWO EPINET
Het belang van epistase en netwerk-rewiring in het bepalen van het adaptief gedrag van bacterien onderworpen aan antibiotica-gradienten
2018
2021
StEQIDEMIC
Ontwikkeling en implementatie van een Belgische platform voor generatie en gebruik van 'whole genome sequencing' (wgs) data voor uitbraakonderzoek, met de voor de mens pathogene Shiga-toxine producerende Esherichia coli (STEC) als case study
2018
2021
KU Leuven PhD Simon Isphording
KU Leuven PhD Simon Isphording
2020
2024
Baekelandmandaat Pieter-Paul Strybol Galapagos
Network-based data-analytics to support pathway-based target discovery in fibrosis-related diseases
2020
2024
FWO PhD Louise De Schaetz van Brienen
A data-driven integrative framework for the identification of cancer driver pathways and their mode of action
2019
2023
FWO PhD Aranka Steyaert
Probalistisch grafische modellen voor een accurate identificatie voor sequentiëringfouten
2018
2022
FWO PhD Maarten Larmuseau
Integratie van systeemgenetische data in kanker voor de identificatie van causale mutaties en hun modus operandi